From: Analysis of gene copy number changes in tumor phylogenetics
Case # | RSMT tree weight (# Steiner nodes) | |||
---|---|---|---|---|
FISHtree | MSTtree | MPTtree | EXACTtree | |
C5 | 195 (13) | 196 (12) | 194 (13) | 194 (13) |
C6 | 82 (2) | 82 (2) | 81 (5) | 81 (4) |
C8 | 103 (6) | 103 (6) | 100 (9) | 100 (8) |
C9 | 143 (1) | 142 (2) | 142 (5) | 142 (2) |
C10 | 87 (0) | 86 (1) | 86 (1) | 86 (1) |
C12 | 72 (1) | 71 (2) | 71 (2) | 71 (2) |
C13 | 150 (5) | 150 (5) | 149 (7) | 149 (7) |
C15 | 74 (1) | 73 (2) | 73 (2) | 73 (2) |
C18 | 127 (4) | 127 (4) | 126 (6) | 126 (6) |
C21 | 73 (4) | 74 (3) | 73 (5) | 73 (4) |
C27 | 59 (1) | 57 (3) | 57 (2) | 57 (3) |
C29 | 83 (2) | 82 (3) | 81 (3) | 81 (3) |
C30 | 118 (9) | 118 (9) | 116 (9) | 116 (10) |
C32 | 209 (7) | 207 (9) | 205 (14) | 205 (13) |
C34 | 83 (5) | 82 (6) | 82 (6) | 82 (6) |
C35 | 67 (1) | 67 (1) | 66 (2) | 66 (3) |
C42 | 199 (7) | 198 (9) | 197 (12) | 197 (11) |
C45 | 172 (10) | 169 (13) | 169 (14) | 169 (15) |
C46 | 110 (5) | 109 (6) | 108 (8) | 108 (7) |
C49 | 162 (4) | 161 (5) | 161 (7) | 161 (7) |
C53 | 80 (3) | 79 (4) | 79 (4) | 79 (4) |
C54 | 146 (6) | 145 (7) | 144 (10) | 144 (9) |